Diversidad genética de SNPs y su relación con enfermedades en ganado lechero de Veracruz, México
DOI:
https://doi.org/10.34188/bjaerv8n1-118Palavras-chave:
SNP, frecuencias alélicas, FST, análisis funcional, gen candidatoResumo
El uso de polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) en ganado bovino lechero puede proporcionar información de enfermedades a las que están asociados, a través de la identificación de genes candidatos y los procesos biológicos en que están involucrados. Por lo que el objetivo del presente estudio fue estimar diversidad genética en 25 SNP asociados a enfermedades en dos poblaciones de ganado lechero en la zona central del estado de Veracruz. Para ello se genotiparon un total de 290 muestras con el panel Bovine Genotyping BeadChip de 150,000 SNP, de los cuales se seleccionaron 25 marcadores asociados a enfermedades en ganado lechero. Para determinar diversidad genética se estimaron frecuencias alélicas, Índice de Fijación de Wright (FST), heterocigosidad esperada (He) y observada (Ho) mediante el software PLINK v1.9. Adicionalmente se realizó el análisis funcional de los genes candidatos mediante la aplicación web GOnet. La frecuencia máxima, mínima y promedio del alelo mayor fueron 0.91, 0.53y 0.71, respectivamente, y el valor máximo de FST fue de 0.28. Los marcadores con frecuencias del alelo mayor a 0.80 están asociados a problemas de laminitis, endometritis, mastitis clínica y disminución de la fertilidad. Dichos resultados permiten concluir que las poblaciones de ganado lechero especializado y de doble propósito en la zona central del estado de Veracruz presentan frecuencias alélicas altas para algunos marcadores de interés asociados a enfermedades y que existe poca diversidad genética para la mayoría de los marcadores entre poblaciones.
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