Vantagens e limitações dos diferentes tipos de docagem molecular na predição de interações ligante-molécula alvo: uma revisão

Abstract

Com ampla aplicação no desenvolvimento de fármacos a partir das interações químicas entre moléculas alvos e potenciais ligantes de interesse, a técnica de docagem molecular caracteriza-se como um processo preditivo pelo qual pequenas moléculas são acopladas a estruturas macromoleculares, gerando valores de pontuação complementares a partir do encaixe em seus respectivos sítios de ligação. Assim, a presente revisão de literatura objetivou descrever os princípios básicos e as etapas gerais envolvidos neste procedimento experimental, bem como identificar as vantagens e as limitações dos diversos tipos de docagem molecular na predição de interações entre proteína-ligante. Os resultados apresentados nesta revisão de literatura enfatizam que a escolha e a seleção do tipo de docagem molecular nestas análises preditivas devem estar embasadas nos objetivos propostos em cada pesquisa, considerando as vantagens e as limitações concernentes a pose correta e a previsão de afinidade da interação, dois pilares essenciais ao êxito destas análises moleculares. Mesmo que tais limitações ainda constituam grandes desafios a serem vencidos, as análises de docagem molecular representam uma das mais promissoras metodologias à indústria farmacêutica para predizer a interação fármaco-molécula de interesse nos ensaios de triagem de potenciais princípios ativos.