Identificación del reservorio de Fiebre Hemorrágica Argentina mediante la técnica de PCR-RFLP / Identification of the Argentine Hemorrhagic Fever reservoir using PCR-RFLP
DOI:
https://doi.org/10.34188/bjaerv4n1-109Palavras-chave:
Fiebre Hemorrágica Argentina, Mammarenavirus argentino, Calomys musculinus, PCR-RFLP, Citocromo b.Resumo
La Fiebre Hemorrágica Argentina (FHA) es una enfermedad zoonótica viral transmitida por roedores cuya tasa de letalidad se encuentra entre el 15 y el 30%. El roedor Calomys musculinus es el reservorio del Mammarenavirus argentino, agente etiológico de la FHA. El seguimiento de sus poblaciones a través de la vigilancia continua representa uno de los instrumentos para reconocer y reducir al mínimo el impacto de la enfermedad. En este estudio, se evaluó la utilidad de la técnica de PCR-RFLP (Amplificación en cadena de la polimerasa–Polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción) del gen mitocondrial Citocromo b (Cytb), usado como marcador genético para la identificación de especies del género Calomys. Se utilizaron secuencias de consensos del gen Cytb de distintas especies del género Calomys (C. musculinus, C. callidus, C. laucha y C. boliviae) para seleccionar in silico las enzimas de restricción (ER) a utilizar. Como resultado de esta selección se eligió la ER AluI. Los resultados de la amplificación del gen por PCR seguidos de la digestión con AluI se visualizaron en geles de agarosa. La obtención de patrones diferenciales de bandas permitieron discriminar las diferentes especies en estudio, haciendo posible la identificación de C. musculinus. La identificación molecular de las especies por la secuenciación de marcadores genéticos es la técnica gold estándar, sin embargo, los resultados obtenidos demuestran que la identificación del reservorio por la técnica de PCR-RFLP reemplazaría, en principio y puntualmente para la identificación de dicha especie, la secuenciación genómica, la cual requiere mayores costos y mayor tiempo, permitiendo priorizar mediante esta técnica el análisis virológico.
Referências
Anderson, S., & Yates, T. L. (2000). A New Genus and Species of Phyllotine Rodent from Bolivia. Journal of Mammalogy, 81(1), 18-36. https://doi.org/10.1644/1545-1542(2000)081<0018:ANGASO>2.0.CO;2
Barrera Oro, J. G., & McKee, K. T. (1991). Toward a vaccine against Argentine hemorrhagic fever. Bulletin of the Pan American Health Organization, 25(2), 118-126.
Behere, G. T., Tay, W. T., Russell, D. A., & Batterham, P. (2008). Molecular markers to discriminate among four pest species of Helicoverpa (Lepidoptera: Noctuidae). Bulletin of Entomological Research, 98(6), 599-603. https://doi.org/10.1017/S0007485308005956
Briggiler, A., Sinchi, A., Coronel, F., Sánchez, Z., Levis, S., Taylor, J., & Enria, D. (2015). [New transmission scenarios of the Argentine hemorrhagic fever since the introduction of the live attenuated junin virus vaccine (Candid #1): An experience in migrant workers]. Revista Peruana De Medicina Experimental Y Salud Publica, 32(1), 165-171.
Carr, S., & Marshall, H. (2011). Detection of Intraspecific.DNA Sequence Variation in the Mitochondrial Cytochrome b Gene of Atlantic Cod (Gadus morhua) by the Polymerase Chain Reaction. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 48, 48-52. https://doi.org/10.1139/f91-007
Corachm, D., & Semorile, L. (1989). Marked restriction pattern differnes in two closely related species of the genus Calomys (Rodentia, cricetidae). Rev. Bras. Genét, 235-246.
Enria, D. A., Briggiler, A. M., & Feuillade, M. R. (1998). An overview of the epidemiological, ecological and preventive hallmarks of Argentine haemorrhagic fever (Junin virus). Bulletin de l’Institut Pasteur, 96(2), 103-114. https://doi.org/10.1016/S0020-2452(98)80004-3
García, J. B., Morzunov, S. P., Levis, S., Rowe, J., Calderón, G., Enría, D., Sabattini, M., Buchmeier, M. J., Bowen, M. D., & St Jeor, S. C. (2000). Genetic diversity of the Junin virus in Argentina: Geographic and temporal patterns. Virology, 272(1), 127-136. https://doi.org/10.1006/viro.2000.0345
GelQuest©. 2006. SequentiX- Digital DNA Processing. Disponible en www.sequentix.de
González Ittig, R. E., & Gardenal, C. N. (2002). Haplotype diversity of the mitochondrial DNA D-loop region in Calomys musculinus (Rodentia, Muridae) detected by PCR-RFLP. Biochemical Genetics, 40(9-10), 293-302. https://doi.org/10.1023/a:1020250701882
González Ittig, RE; Gardenal, CN. (2004). Recent range expansion and low levels of contemporary gene flow in Calomys musculinus: its relationship with the emergence and spread of Argentine haemorrhagic fever. Heredity, 93(6):535-541.
González-Ittig, R., Chiappero, M., Blanco, A., Provensal, M., & Gardenal, C. (2002). Accurate identification of three cryptic species of rodents of the genus Calomys using RAPD-PCR and mitDNA RFLP markers. Biochemical Systematics and Ecology, 30, 425-432. https://doi.org/10.1016/S0305-1978(01)00107-7
González-Ittig, R. E., Patton, J. L., & Gardenal, C. N. (2007). Analysis of Cytochrome-b Nucleotide Diversity Confirms a Recent Range Expansion in Calomys musculinus (Rodentia, Muridae). Journal of Mammalogy, 88(3), 777-783. https://doi.org/10.1644/06-MAMM-A-091R1.1
González?Ittig, R. E., Salazar?Bravo, J., Barquez, R. M., & Gardenal, C. N. (2010). Phylogenetic relationships among species of the genus Oligoryzomys (Rodentia, Cricetidae) from Central and South America. Zoologica Scripta, 39(6), 511-526. https://doi.org/10.1111/j.1463-6409.2010.00446.x
González-Ittig, R., Kandel, N., Levis, S., Calderon, G., Salazar-Bravo, J., & Gardenal, C. (2014). Molecular systematics of the South American rodent Calomys laucha (Cricetidae: Sigmodontinae), a reservoir of the Laguna Negra hantavirus. Canadian Journal of Zoology, 92. https://doi.org/10.1139/cjz-2014-0133
Haag, T., Muschner, V. C., Freitas, L. B., Oliveira, L. F. B., Langguth, A. R., & Mattevi, M. S. (2007). Phylogenetic Relationships among Species of the Genus Calomys with Emphasis on South American Lowland Taxa. Journal of Mammalogy, 88(3), 769-776. https://doi.org/10.1644/05-MAMM-A-319R1.1
Kocher, T. D., Thomas, W. K., Meyer, A., Edwards, S. V., Pääbo, S., Villablanca, F. X., & Wilson, A. C. (1989). Dynamics of mitochondrial DNA evolution in animals: Amplification and sequencing with conserved primers. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 86(16), 6196-6200. https://doi.org/10.1073/pnas.86.16.6196
Maes, P., Alkhovsky, S. V., Bào, Y., Beer, M., Birkhead, M., Briese, T., Buchmeier, M. J., Calisher, C. H., Charrel, R. N., Choi, I. R., Clegg, C. S., de la Torre, J. C., Delwart, E., DeRisi, J. L., Di Bello, P. L., Di Serio, F., Digiaro, M., Dolja, V. V., Drosten, C., … Kuhn, J. H. (2018). Taxonomy of the family Arenaviridae and the order Bunyavirales: Update 2018. Archives of Virology, 163(8), 2295-2310. https://doi.org/10.1007/s00705-018-3843-5
Maiztegui, J. I. (1975). Clinical and epidemiological patterns of Argentine haemorrhagic fever. Bulletin of the World Health Organization, 52(4-6), 567-575.
Maiztegui, J. I., McKee, K. T., Barrera Oro, J. G., Harrison, L. H., Gibbs, P. H., Feuillade, M. R., Enria, D. A., Briggiler, A. M., Levis, S. C., Ambrosio, A. M., Halsey, N. A., & Peters, C. J. (1998). Protective efficacy of a live attenuated vaccine against Argentine hemorrhagic fever. AHF Study Group. The Journal of Infectious Diseases, 177(2), 277-283. https://doi.org/10.1086/514211
Mills, JN; Childs, JE; Ksiazek TG; Peters CJ. (1995). Methods for Trapping and Sampling Small Mammals for Virologic Testing (en línea). Atlanta, USA, Centers for Disease Control and Prevention. 54 p. Consultado 14 feb. 2019. Disponible en https://stacks.cdc.gov/view/cdc/11507
Nasri, T., Hedayati, M. T., Abastabar, M., Pasqualotto, A. C., Armaki, M. T., Hoseinnejad, A., & Nabili, M. (2015). PCR-RFLP on ?-tubulin gene for rapid identification of the most clinically important species of Aspergillus. Journal of Microbiological Methods, 117, 144-147. https://doi.org/10.1016/j.mimet.2015.08.007
Polop, J., Calderón, G., Feuillade, M. R., García, J., Enria, D., & Sabattini, M. (2007). Spatial variation in abundance of the junin virus hosts in endemic and nonendemic Argentine haemorrhagic fever zones. Austral Ecology, 32(3), 245-253. https://doi.org/10.1111/j.1442-9993.2007.01679.x
Simone, I., Provensal, C., & Polop, J. (2012). Habitat use by corn mice (Calomys musculinus) in cropfield borders of agricultural ecosystems in Argentina. Wildlife Research, 39(2), 112-122. https://doi.org/10.1071/WR11065
Steinmann, A., José, S., & Priotto, W. (2011). “El ratón maicero y su comportamiento”. Ciencia Hoy; Revista de divulgación científica y tecnológica de la Asociación Civil Ciencia Hoy.
Vanlerberghe-Masutti, F. (1994). Molecular identification and phylogeny of parasitic wasp species (Hymenoptera: Trichogrammatidae) by mitochondrial DNA RFLP and RAPD markers. Insect Molecular Biology, 3(4), 229-237. https://doi.org/10.1111/j.1365-2583.1994.tb00171.x
Wilson, AC; Zimmer, EA; Prager, EM; Kocher, TD. (1989). Restriction mapping in themolecular systematics of mammals: a retrospective salute. Pág. 407–419 en Thehierarchy of life (Fernholm, B; Bremer, K; Jornwall, H eds.). Proceedings of the NobelSymposium 70. Elsevier, Ámsterdam, Países Bajos.
Downloads
Publicado
Como Citar
Edição
Seção
Licença
- O conteúdo dos artigos é de responsabilidade exclusiva dos autores.
- É permitida a reprodução total ou parcial do conteúdo dos artigos, desde que citada a fonte.
- Artigos com plágio serão recusados, e o autor do plágio perderá o direito de publicar nesta revista.
- Os nomes e endereços informados nesta revista serão utilizados exclusivamente para os serviços prestados por esta publicação e não estão disponíveis para outros fins ou a terceiros.
- Depois de enviar os artigos, os autores cedem os direitos autorais de seus artigos ao BJAER. Se você se arrepender da submissão, o autor tem o direito de solicitar ao BJAER que não publique seu artigo. Porém, essa solicitação deve ocorrer até dois meses antes da divulgação do número que o artigo será publicado.
- O BJAER usa a licença Creative Commons CC BY. Informações sobre esta licença podem ser encontradas em: https://creativecommons.org/licenses/by/3.0/br/
Brazilian Journal of Animal and Environmental Research (BJAER) se reserva o direito de efetuar nos originais alterações de ordem normativa, ortográfica e gramatical, com vistas a manter o padrão culto da língua, respeitando, porém, o estilo dos autores. Os trabalhos finais não serão enviadas aos autores.
